在墨蘭的栽培過程中，軟腐病危害比較普遍和嚴重，嚴重時甚至全部死亡。[8]
防治方法：
- 加強檢疫：為了防止軟腐病從外地傳入，在調運蘭花種苗、蘭株等繁殖材料或成品材料時，必須經過檢疫，在取得檢疫部門簽發的植物檢疫證書后，方可調運。
- 選擇無病繁殖材料： 由于病原菌可經病株傳播，在蘭株繁殖時（多為分株繁殖），必須選用健康無病的蘭株作母株，發現病株立刻銷毀，并對剪刀等工具進行消毒，以培養無病種苗。有條件的蘭場最好建立健康種苗的自繁自育制度，盡量不從其他蘭場購買種苗，以確保種苗無病。
- 種苗消毒：為了減少和避免由種苗帶菌傳播，在蘭株分株繁殖時應對種苗消毒。消毒方法：數量較少時，用毛筆蘸70%甲基托布津粉直接涂上切口。數量較大時，用70%甲基托布津500倍液噴灑切口和根部，晾半天后栽種。
- 使用一次性植料、盆具：墨蘭軟腐病原菌可經栽培基質等傳播，因此種植墨蘭時，提倡使用一次性植料，而不提倡使用傳統的種蘭植料塘泥。舊的植料一不用，也不能用新舊料混合種蘭，以免造成病菌傳播。為了避免病原菌經盆具傳播，要選擇新盆具。如果名貴盆具不舍得棄用，也要放在陽光下暴曬一段時間，然后用藥劑消毒后才可使用。
- 改變分株時間：把春季分株改為秋季分株。傳統的分株時間多數在春季進行，但春季由于雨水多、濕度大，分株時形成的切口容易感染病菌，同時由于春季氣溫較低，切口愈合較慢，從而增加了病菌感染的機會。而秋季氣溫25℃-30℃左右，切口愈合較快，且秋季濕度較小，病菌感染機會較少。
- 加強肥水管理：在春季施8克/盆酵素菌能有效減輕軟腐病病害。冬春季也可施3克/盆好康多和奧綠肥長效肥，肥效可達半年。分株后不要立刻澆水，以免切口感染病菌，分株2-3天后再澆水。在水分的日常管理中，保持基質濕潤即可，特別是在4-7月軟腐病高發時期不宜大量澆水，如果天氣干燥，可以采用向葉面、地面、空中灑水的方式來保持空氣濕度。
- 搞好蘭場衛生：在蘭場的日常管理中，要及時清理落葉、枯葉、蘭株殘體，并集中處理，減少病菌附生。發現病株，要立刻銷毀，減少傳染源，同時對整個蘭場進行消毒。此外，春季可施熟石灰粉50千克/畝1-2次，直接撒于整個蘭園，石灰粉可起消毒作用，不會灼傷蘭葉和蘭株。
- 改善環境條件：蘭花喜陰涼，耐干旱，宜通風，忌污染。散射光有利于蘭花的生長，而強烈的直射光不利于蘭花的生長。場地閉塞、通風不良會導致蘭花生長受阻，并容易感染病蟲害。因此，蘭棚周邊離地1米高處要開通透風，通風方式為自然通風、風扇輔助通風。在廣東地區，冬春季至夏初（11月至翌年5月）遮蓋遮光率為75%～85%的遮陽網，6-10月需遮蓋雙層遮陽網。
- 合理使用農藥： 在充分了解農藥性能和使用方法的基礎上，根據原菌種類對癥下藥，使用合適的農藥類型或劑型。蘭花軟腐病主要以防為主，蘭花分株后3個月內、4-8月及夏季大雨之后，要特別注意用藥，每隔15天左右用藥一次，可選用大生300倍液、滅病威300倍液、70%甲基托布津800倍液等藥劑，注意交替使用。
